En introduktion till streptomyceter

Streptomyces-bakterier uppskattas ha funnits på jorden i ungefär 400 millioner år. Men, det är endast under det senaste århundradet som de fått den uppmärksamhet som de rikligt förtjänar.1943 beskrevs Streptomyces för första gången som aerobiska, filmentösa, och sporskapande bakterier. Namnet härstammar från latinska ordet Strepto (skruvad) och myces (svamp). Trots referensen till svampar, så har dessa mikrober och deras släktingar varit erkända som bakterier åtminstone sedan 1940-talet. Det finns idag >1,100 namngivna streptomyceter, vilket gör dem till ett av de största bakteriella släktena.

Streptomyceter är rikligt förekommande i världen runtomkring oss och kan lätt odlas. De är mest kända som jordbakterier; men de kan också hittas i marina sediment och i färskvattensekosystem. Medan den största majoriteten av streptomyceter som studerats till idag är frilevande, så har det på senare år blivit uppenbart att dessa mikrober även leva i association med andra organismer, så som insekter, svampar, och växter. Värt att nämna är att det endast finns ett fåtal Streptomyces arter som kan orsaka sjukdom hos människor.

Det finns en mängd egenskaper som har gjort streptomyceter till fascinerande organismer att studera. Några av dessa är att de har linjära kromosomer till skillnad från många andra bakterier som har cirkulära kromosomer, deras svampliknande sätt att växa på, och deras imponerande metaboliska förmåga, inkluderat deras förmåga att producera antibiotikor bioaktiva molekyler.

Precis som för många frilevande bakterier har streptomyceter stora kromosomer som sträcker sig 6 till 13 megabaspar. Dessutom har Streptomyces-kromosomer en starkt skev genomisk komposition där 70% av DNAt består av G/C-baser. Eftersom att kromosomen är linjär skapar detta unika utmaningar när kromosomen replikeras, särskilt när ändarna ska dupliceras. Kromosomen är organiserad på ett sätt där gener essentiella för livskraft går att finna runt om den punkt där genomet replikeras först, medan denna region är flankerad av "armar" där många av de art-specifika generna är lokaliserade, inkluderat majoriteten av de genkluster som används för att produceras biosyntetiska molekyler.